Хм.
Я, если честно сталкивался с дверью, месяц!, не меньше её укладывал... Попробую чисто интуитивно посоветовать, на память.
Как вариант - что-то болтается в лонжеронах багажника, прямо вокруг запаски есть отверстия, и что-нибудь завалилось. Потом - снять сиденье заднее, проехаться, можно кого-нибудь за руль посадить. Ничего-себе блин обьем работ "Балку"...
Идем дальше - есть там крепления трака наливной горловины бензобака, сепаратор пластиковый, место крепления бампера.
Ниша заднего крыла, может там просто что лежит, потому, что она глубокая, это гибким шланчиком мягким там шуровать.
Кстати - у меня сам замок багажника срывало с креплений, он там держится на пятых шпильках, приваренных к дверке снутри. И ещё - у замка есть пипирка такая латунная - направляющая, бывает она вырывается, НО создает видимость, что цело все, но когда хлопаешь дверью, эта направляющая лежит сама по себе. Грохот адский, менял уже три замка. Дальше - стойки двери багажника - если разносились шаровые упоры, то тоже стучат. Ну, те места, где прикручиваются, там типа шарового шарнира что-ли. Бывает, что стойки хорошие, а шарнирчик вхлам, аж жаль выкидывать...