Заливать и сливать воду - можно, ничего не будет.
Запускать двиг, когда в системе вода, действительно
нежелательно. Кирдыка помпе не будет, но срок ее
службы сокращается. Накипь вода действительно не смоет,
но там плавает достаточное количество всякого мелкого
говнища смыть которое лишним не будет.
ЗЫ. Когда поставил топливный фильтр в систему охлаждения,
первое время приходилось его менять каждые 1-2 тк.
Забивался так, аж скручивался винтом и отстоя около 1 см.
Не помню сколько их поменял, пока там более менее почистилось.
Сейчас меняю вместе с маслом, через 10тк, и все равно,
говницо всякое там набивается.