Поставщик поставляет товар, по документам кол-во 1 в 1, как указано в счете и договоре, но всегда при этом кладет немного сверху, на случай брака, это "сверху" нигде не указывается и официально по документам не проводится, это - добрый жест поставщика.Товар отправляется другому подрядчику, который его комплектует, после чего образуется некий остаток из "сверхтиражки" неучтенной, который дают на случай брака, второй подрядчик мне ее возвращает вместе с укомплектованной продукцией, существует ли какая-то лазейка, с помощью которой я могу эту неучтенную "сверхтиражку" провести официально? Вопрос, может и тупой, но в этой стране все возможно.

Сделай инвентаризацию и поставь на баланс.

Зачем тебе это?
Сверхтиражку продать, деньги пропить - как-то так

Либо оформить закуп от ООО "Рога и копыта" или физлица, если конечно это не акцизный товар.

По уму поставщик пишет в накладной фактическое количество, а если не хочет брать лишних денег, то выставляет счёт-фактуру со такой скидкой, чтобы она получилась на сумму счёта.