Подскажите как можно проверить нет ли механической ошибки в метках шкивов коленвала или распредвала.

Легко! Устанавливаешь вал по меткам и пробуешь завестись 8-)

Завестись то заведётся, а вдруг на пол зуба несовпадение? Ведь она заводится если и на зуб переставляешь ремень!

Тебе уже написали: Устанавливаешь валы по меткам. Если метки не совпвдают то переставляеш ремень так чтоб метки совпали.

Я спрашиваю потому что по меткам всё ОК, а ощущение что зажигание рановато всё равно. Ставлю на зуб позже, машина заводится , но едет тупо, а когда нормально выставлено то детонация (стук пальцев-называемый в народе) при нагреве после 90 градусов.

Проверь датчик детонации.

как показала практика поверять надо все.
метку на маховике с меткой на шестерни грм.
метку на шестерни видно только при снятом шкиве, но если все чистое то можно попытаться рассмотреть ее не снимая шкива.

потом зафиксировав, коленвал от проварачивания выставлять метки на распред валах.

по метке на крышке у коленвала-грубо,надо смотреть в окошке у КПП. Если 16 V ,то на распредвалах метки смотрят строго вверх на риски в пластмассовом кожухе,если 8,то строго налево на кронштейн кожуха ГРМ

Да менял я их уже штук десять!