Миллиарды лет назад на планету Земля прилетели пришельцы, называющие себя «Uranus» (мы их будем называть Создатели), с целью создать живых существ и набрать из них армию для своих военных нужд. В течении миллионов лет они экспериментировали, управляли экосистемой пытаясь создать существ, которые были бы сильны, умны, послушны, могли приспосабливаться к изменениям окружающей среды и самое главное – имели воинственный характер. Первым продуктом претендующим на должность таких существ были динозавры, но хотя они и имели огромные размеры и физическую силу, они были глупы и совсем не умели адаптироваться к изменениям окружающей среды. Поэтому Создатели решили сильно изменить ход своих разработок изменив окружающую среду Земли метеоритным ударом. Это привело к исчезновению динозавров в пользу развития млекопитающих.

В ходе новых экспериментов Создатели разработали оптимальную форму жизни - человека, которая должна была служить базой для биооружия - Зоаноидов. Зоаноидом называется человек прошедший специальную обработку и по желанию способный «превращаться в монстра»: изменялась масса, внешний вид человека, увеличивалась физическая сила и добавлялись новые способности. Для управления армиями Зоаноидов был создан Зоалорд и назван именем Алканфель (Арканфель, Арханфер). Это был человек сильно отличающийся внешним видом от остальных людей того времени, у него была гладкая белая не покрытая волосами кожа и худощавое телосложение. Создатели наделили Алканфеля способностью полностью управлять Зоаноидами телепатически, как делали сами, а также огромной энергией, которая давала ему невероятную силу. Алканфель был высшим достижением разработок Создателей на Земле. Далее Создатели хотели произвести ещё 11 Зоалордов и свыше миллиарда Зоаноидов и отправиться на огромных кораблях в космос. Но один из Создателей решил провести ещё один внеплановый эксперимент, так как видел в людях много скрытого потенциала. Человек был совмещён с Био-бронёй, защитной системой, которая использовалась Создателями в качестве скафандра. Создатели постоянно находились в Био-броне, которая помимо увеличения их силы, по видимому, давала им некоторые специальные защитные и атакующие возможности. Создателям было интересно, как повлияет их Био-броня на существо, которое создавалась как оружие. Против человека в Био-броне был выставлен динозавр прошедший процедуру похожую на превращение в Зоаноида и имел мощность примерно как целый отряд Зоаноидов. В ходе боя, человек с лёгкостью победил динозавра, разрубив его Вибрирующими Лезвиями, являющимися частью Био-брони. Создатели были поражены, они не ожидали, что способности человека будут на столько улучшены. Как оказалось человек становился примерно в 10 раз мощнее, чем становились Создатели, одевая Био-броню (или броня усиливала человека в 10 раз сильнее, чем усиливала Создателей). Тут же на радостях они решили, что эксперимент заслуживает внимания и что планы нужно менять. Они приказали человеку снять Био-броню и возвратиться в обычное состояние, но человек их не послушал, а выстрелил по одному из кораблей Создателей из Мега-сокрушителя. Мощьнейшый поток частиц пронзил насквозь корабль нанеся колоссальный ущерб. Создатели были шокированы и приказали Алканфелю уничтожить человека, направив на него несколько отрядов Зоаноидов. Но это не помогло, человек убил всех Зоаноидов в считанные секунды. Тогда Создатели направили в бой самого Алканфеля, дав ему Ремувер - прибор способный отделить Био-броню от человека. Алканфель заявил, что ему не нужно такое оружие, но Создатели боялись, что без него он проиграет и тогда они ни как не смогут остановить человека в Броне. Когда Алканфель направлялся к человеку, тот выстрелил из Мега-сокрушителя, Алканфель легко противостоял атаке и добился своего - снял броню, направив на человека Ремувер, а потом по приказу Создателей убил его «взглядом». После этого эксперимента Создатели посовещались и решили покинуть планету и уничтожить её, они увидели в своём творении - человеке большую опасность, так как соединённый с Био-бронёй, которую они использовали ежедневно, он становился полностью не контролируемым, обладая сокрушительной силой. И это был человек, даже не прошедший преобразование в Зоаноида, а что было бы, если Био-броню заполучил Зоалорд? Наверняка его сила превысила бы силу самих Создателей, в том смысле, что такое существо могло запросто уничтожить их всех. И вот, совершенно неожиданно, все корабли Создателей одновременно начали подниматься в небо. Алканфель, увидев это, взлетел и отправился за ними, желая узнать причину их внезапного отлёта. Они объяснили ему, что эксперимент на Земле окончился провалом, а на просьбу Алканфеля взять его с собой ответили отказом, сказав ему, что он потенциально вне контроля и не пригоден. Алканфель спросил: "Почему тогда вы создали нас?" Ответом Создателей был мощнейший удар молнии, который пронзил и парализовал Алканфеля (это был мысленный приказ Алканфелю - не двигаться). Улетая создатели назвали Гайвером человека совмещённого с их Био-бронёй, это слово означало на их языке что-то "вне контроля" или "за пределами нормы". Через секунды корабли скрылись в открывшихся порталах, а ещё через несколько открылся другой портал, через который по направлению к Земле летел огромный астероид, размером с Марс. Алканфель видел это и смог разбить астероид расширив до огромных размеров своё защитное поле и полетев ему навстречу. Сравнительно небольшие остатки метеорита обрушились на Землю и вызвали глобальное изменение климата, но человечеству удалось выжить, так как Создатели позаботились наделить его способностью адаптироваться. Алканфель был сильно ранен и нуждался во сне, он поместил себя в одну из капсул для подпитки энергией в корабле Создателей, разрушенном Гайвером. Со временем из-за перемещения материков это место превратилось в небольшой остров, а люди жившие на нём построили храм вокруг корабля, где спал их спаситель...


Через десятки тысяч лет после отбытия Создателей, примерно в 1600 году на этот остров (остров Silha) случайно попал человек преклонного возраста - Хамилкал Балкус. Он плыл на гражданском корабле из Португалии в Бразилию и потерпел крушение возле берегов Силхи, так как там были постоянные штормы из-за сильного психического поля излучаемого останками корабля Создателей. Очнувшись на берегу он начал осматриваться и наткнулся на невероятных созданий: русалки, гигантские стрекозы и птицы, динозавры. В страхе бежав от них он споткнулся прямо возле лестницы ведущей к входу в храм Алканфеля. Балкус почувствовал, что его кто-то ждёт внутри и пошёл вверх. Войдя внутрь он обнаружил спящего Алканфеля в капсуле. Дотронувшись до капсулы, Балкус разбудил Алканфеля. Тот поведал Балкусу свои намерения, он хотел создать ещё 11 Зоалордов, набрать армию Зоаноидов и отправится в космос за Создателями. Один из Зоакристалов Алканфеля был вынут из его тела и на его основе были созданы остальные 11, один из которых достался Балкусу и сделал его Зоалордом. Всё последующее время до наших дней Балкус искал оставшихся 10-ых людей. После того, как все были в сборе, были построены специальные базы и завершено создание организации Кронос. Через некоторое время Балкус обнаружил, что Алканфель не совсем здоров и его состояние ухудшается. Алканфеля не было видно целый год и Балкус, отправившись на Силху, обнаружил его лежащим на полу без сознания. Оказалось, что Алканфель периодически впадал в что-то наподобие комы и продолжительность таких периодов всё более возрастала...


...В наши дни на одной из баз Кроноса, расположенной внутри горы Минаками в Японии, в ходе исследования уцелевшего корабля Создателей были обнаружены три блока Био-брони и один Ремувер. Агито Макишима, который хотел их заполучить, организовал похищение блоков. Исполнителем стал Зоаноид Малмот, тестовый образец. За ним была организована погоня и в итоге его зажал в угол отряд бойцов Кроноса в районе горы Нарисава. Малмот в ходе сопротивления взорвал гранату в непосредственной близости с собой и кейсом с блоками. Малмот погиб, а блоки разлетелись во все стороны. Один из них приземлился рядом с Шо Фукамачи и Тецуро Сегава, которые отдыхали возле озера после окончания учебного дня. Шо с любопытством начал рассматривать блок и случайно активировал его, после чего, превратился в Гайвера 1. Отряд Кроноса нашёл один блок, который был повреждён и продолжая поиски вышел прямо к тому месту, где был Тецуро. Один из бойцов - Зоаноид Грегол захотел убить Тецуро, но тут появился Гайвер 1 и легко расправился с ним. С этого момента Кронос пытается захватить Гайвера 1, а точнее его Контрольное Устройство, отправляя за ним Зоаноидов и похищая его друзей. Второй блок Био-брони был активирован инспектором американского отделения Кроноса, Освальдом Лискером, в ходе его осмотра. Лискер стал Гайвером 2 и решил сам пойти захватить Гайвера 1. В ходе драки преимущество было на стороне Лискера, так как он был отлично тренированным бойцом, но его контрольное устройство дало сбой из-за повреждения и Гайвер 1 выбил его, после чего Лискер погиб.

В Японию прибывает один из Зоалордов, Рихард Гиот, чтобы сменить на посту командующего Гензо Макишиму, который был обвинён в неудачах по возвращению блоков. На самом деле его основной целью было получение одного из блоков для себя, чтобы стать Гайвером-Зоалордом и предать Кронос. Такое отступничество Гиота можно объяснить тем, что когда он проходил превращение в Зоалорда, Алканфель находился во сне и слабо мог контролировать других Зоалордов. Гиот отправил за Гайвером 1 своего Гипер Зоаноида, Зербубуса, но тот был убит неожиданно появившимся Гайвером 3. Это был Агито Макишима, который всё таки заполучил один блок. Гензо Макишима был превращён в Энзайма, специального Зоаноида, способного специальным веществом легко разъедать броню Гайвера. В драке с Энзаймом Гайвер 1 потерпел поражение, скорее по неопытности, и его Контрольное Устройство было вырвано и отправлено в штаб квартиру Кроноса. Через некоторое время Контрольное Устройство неожиданно начало восстанавливать Гайвера 1 и когда процесс завершился, он в несознательном состоянии начал убивать окружающих Зоаноидов и придя в себя оказался рядом с камерой, в которой был заключён его друг Тецуро. В это же время Гайвер 3 уничтожал колбы с проходящими обработку Зоаноидами и устроил несколько взрывов в здании штаб квартиры, после чего небоскрёб был полностью разрушен.

Агито думал, что Гиот погиб при разрушении штаб квартиры, но придя домой, обнаружил его в своей гостиной. Гиот скорее всего уже догадывался, что Гайвер 3 это Агито, но не показывал этого. Агито трансформировался в Гайвера и напал на Гиота, но тот показал огромную силу и позвал на помощь команду Потерянных Юнитов трёх “неудавшихся Зоаноидов” (Аптом, Сомлум и Дайм) и Гайвер 3 отступил сбежав. В это время Кроносом были захвачены отец Шо – Фумио Фукамачи и Тецуро с Мизуки. Гайвер 1 направляясь спасти друзей и отца был заманен в ловушку тремя Потерянными Юнитами, но вмешавшийся журналист Масаки Мураками помог ему. Сомлум и Дайм были убиты, а Аптом отозван на базу. Шо и Масаки отправились вместе на базу Кроноса в горе Минаками, где уже начал действовать Гайвер 3, освободив Фумио и остальных. Когда они пытались выбраться с базы, на них напала “Команда Гипер Зоаноидов Пять” (Зэкстол, Дэрзерб, Элеген, Гастер и Танкрус). Тут же подоспел Гайвер 1, им удалось спасти Тецуро и Мизуки, но отец Шо всё же был схвачен и превращён доктором Балкусом в Энзайма 2. Ночью, Шо и Агито на пару направились выручать Фумио и без особого труда выбрались с ним на поверхность, где на них напала тройка из команды Гипер Зоаноидов 5. Гайвер 3 остался сражаться с ними и убил Танкруса, а Гайвер 1 бежал к укрытию с отцом на плечах. Тут Фумио трансформировался в Энзайма 2 и начал драться с Шо. Шо не мог нормально сражаться с отцом и получил тяжёлое повреждение мозга, после чего Гайвер начал бессознательную деятельность и убил Энзайма 2. В последствии Шо на некоторое время потерял возможность трансформироваться из-за психологической травмы. На Шо и остальных было новое нападение несколькими Энзаймами 2 и сражаться с ними пришлось Мураками и Агито. Кое-как справившись и не успев передохнуть, против них вышел сам Гиот в боевой форме Зоалорда. В ходе битвы он совершил сильный взрыв, потерял сознание и думал, что уничтожил Гайвера 3 и Мураками, но тем удалось скрыться пробив дыру в земле. Отряды Кроноса прочёсывали местность, пытаясь найти Гайвера 1 и найдя его, были убиты Аптомом, который был уже вне контроля доктора Балкуса, сильно модифицировавшего его. Аптом хотел отомстить за своих друзей, Сомлума и Дайма, сразившись самому с Гайвером 1, и у него получилось вернуть Шо способность трансформироваться, начав издеваться над Мизуки. Аптом был побеждён, но не убит.


Лишившись большей части тела, он подстерёг приближавшуюся четвёрку Гипер Зоаноидов и набросился на Элегена, поглотив его, после чего скрылся. Новым укрытием компании послужил последний уровень базы Кроноса внутри горы Минаками, где им помог схорониться доктор Одагири с небольшой группой учёных (в том числе и Хайами). Чуть позже возле горы Минаками появился Алканфель. Он столкнулся с Аптомом и оставил от него только руку и голову выстрелив мощным лучом и направился на базу. Алканфель знал, что Гиот прячет Ремувер и все его намерения. Он приказал Гиоту отдать Ремувер, но тот отказался и при попытке бежать ввязался в драку. Алканфеля засосало в чёрную дыру созданную Гиотом, которую он потом еле закрыл и то, с помощью доктора Балкуса. В это время Гайвер 1 и Гайвер 3 проникли в Корабль Создателей и Шо удалось взять контроль над ним. А Аптому удалось восстановится, проникнуть на базу и поглотить Дэрзерба и Гастера. Аптом также смог взять образец Зекстола, схватив его за ногу и начав поглощать, но тот отстрелил её и скрылся. Гиот закрыв чёрную дыру упал на нижний уровень и столкнулся с Мураками и Гайвером 1. Он обрадовался и призвал Ремувер, потом попытался снять Био-броню с Агито, но энергии не хватило. Мураками, выстрелив по Гиоту, смог выиграть время, чтобы все успели зайти в Корабль Создателей и он начал взлетать. Когда Мураками уже собирался войти в Корабль, его схватил Гиот и начал избивать. Шо не выдержал и вылез из Корабля, а за ним и Агито. Гиот опять попытался снять с Гайвера 3 броню, но им помешали 10 Зоалордов, которые начали обстрел Корабля, чтобы не дать Гайверам уйти. Гиот попытался скрыться с Ремувером и был остановлен Алканфелем, который, видимо, без труда выбрался из чёрной дыры. Он парализовал Гиота и вынул его Зоакристал. Когда он хотел забрать и Ремувер, Гайвер 3 выстрелил Гравитационной Сферой в Гиота и тот упал куда-то вниз вместе с Ремувером. Тут же Гайвер 1 и Гайвер 3 решили атаковать Алканфеля Мега-сокрушителями, но Алканфель одной рукой отразил их выстрел, направив его обратно и уничтожив Корабль Создателей. В этот момент Шо, почти растворившись, имея связь с Кораблём, пожелал чтобы его компания телепортировалась в безопасное место, а для себя силу способную победить Алканфеля. Его друзья телепортировались в район горы Нарисава, а его Контрольное устройство слилось с Навигационными сферами Корабля и образовало огромный кокон, в котором в течении года формировался Гигантик (Гигантский) Гайвер. Кокон перенёсся в горы на границе штата Монтана (США) и Канады и был найден Кроносом. Год компания скрывалась в доме Нацуки, а Аптом незаметно наблюдал за ними, ожидая возвращения Гайвера 1 для мести.

17 августа 199х года Кронос захватил всю Землю всего за один день. Агито Макишима создал организацию сопротивления “Молния Зевса” и искал, где Кронос прячет кокон. В Токио для поимки Аптома был выпущен Нео-Зэкстол. Их бой привлёк внимание компании, они думали, что Шо вернулся и побежали смотреть. Аптом проигрывал и Мизуки, считая что это Шо, закричала его имя и вызвала телепортацию кокона на место событий. Гайвер 3 прямо перед телепортацией обнаружил местоположение кокона и переместился в Токио вместе с ним. Нео-Зэкстол успешно сражался и с Гайвером 3, но очередной крик Мизуки, вызвал раскрытие кокона и появление Гигантик Гайвера, который выстрелив из Гига-сокрушителя уничтожил Нео-Зэкстола...


Шо проснулся в том самом доме Нацуки, где компания ждала его возвращения в течении года. Ему пояснили ситуацию и рассказали, что группа учёных, которая помогала им укрываться в горе Минаками скорее всего уже мертва, так как они не добились получения вакцины от вируса, которым Кронос заражал всех своих учёных. В это время в Аризоне был созван совет 12 Зоалордов для решения проблемы с новым Гайвером. Алканфель завершил заседание представлением 13 Зоалорда - Имакарума Мирабилис, который представлял собой тело Масаки Мураками с его памятью, но являлся совсем другой личностью. Имакарум сразу прибыл в Токио, где Гайвер 1 и Гайвер 3 решили напасть на небоскрёб Кроноса - Облачные Врата. Они разделились и Шо в форме Гигантика с лёгкостью прорвался через толпы Зоаноидов, охраняющих здание. Шо и Агито встретились возле входа в командную комнату. Там они встретили Имакарума и завязалась драка. Шо видел в Имакаруме своего друга и поэтому не мог нормально сражаться. К драке присоединился Аптом. Он отнёс Шо в сторону и несколько раз неудачно попытался атаковать Имакарума. Гайвер 3 неожиданно проломил стену и почти достал Имакарума, но всего лишь разрубил ему очки. Имакарум трансформировался в боевую форму и начал действовать жёстче, он схватил Гайвера 1 пытаясь вытащить его Контрольное Устройство и Шо вызвал Гигантика. Он сделал отвлекающий выстрел из Гига-сокрушителя и скрылся вместе с Аптомом и Гайвером 3.

Через некоторое время на базе на Мёртвом Море 12 Зоалордов провели тесты подняв из воды новое творение Кроноса - огромный космический био-корабль Ковчег (50 км в длину), выращенный из куска ткани уничтоженного Корабля Создателей. Они управляли им мысленно и отправили на околоземную орбиту для дальнейшей подпитки солнечной энергией... Чуть позже Алканфель показал Имакаруму своё убежище на острове Силха, где на его глазах упал теряя сознание и заснул. Имакурум при этом пообещал ему достать блок Био-брони.

В Токио Аптом встретил живого Хайами (единственный выживший учёный из группы во главе доктора Одагири), который стал теперь Потерянным Номером (единственное средство побороть вирус) и они вместе пришли в дом к Нацуки. Тут же на дом было совершено нападение группы Зоаноидов, это были Ваморы и новый вид Энзаймов - Энзайм 3. Дом был полностью разрушен и компания попыталась оторваться от преследования, но их встретил Имакарум. Аптом и Гайвер 3 защищая компанию начали сражаться с Энзаймами 3, а Гигантик Гайвер взял на себя Имакарума. Аптом захватил троих Энзаймов 3, Гайвер 3 уничтожил их Мега-сокрушителем, но четвёртый Энзайм 3 сумел скрыться под землёй и выпрыгнул прямо перед Агито. Ёхей Онума закрыл Гайвера 3 своим телом и погиб будучи пронзён лапой Энзайма 3, при этом Агито тоже был ранен. Хайами удалось отвлечь Энзайма 3, трансформировавшись в боевую форму и заморозив его, после чего Гайвер 3 разрушил замёрзшее тело Звуковой Атакой. В это время Гигантик Гайвер почти добился успеха - он уже был готов отрубить Имакаруму голову, но опять увидел в нём друга и не смог. Шо снял Гигантскую Био-броню и был схвачен Имакарумом за голову. Агито убедил Гайвера 1 вызвать Гигантика опять и дать ему контроль над ним, потому что Шо был уже на грани смерти и сам не мог одеть Гигантскую Броню. Гайвер 3 трансформировался в Гигантик Дарка, он преследовал Имакарума до густо населённой части Токио и там начал сражение. Имакарум хотел чтобы Гигантик Дарк не мог сражаться в полную силу, полагаясь на то, что он не станет жертвовать мирным населением. Макишиме было безразлично, он умело атаковал Имакарума и в конце концов вынудил его применить Атаку Чёрной Дыры. Эта атка тоже не помогла Имакаруму, Гигантик Дарк разрушил Чёрную Дыру выстрелом из Гига-сокрушителя и тут же нанёс мощный удар рукой прямо по его Зоакристалу. Зоакристал треснул, Агито захотел нанести ещё улар, но потерял контроль над Гигантской Бронёй - она снялась с него из-за истощения энергии. Гайвер 3 почувствовав приближение Зоалорда Пургстала, который спешил разобраться, что происходит, скрылся в глубине моря, Имакарум упал тоже в воду. Тут же появился Алканфель, который был разбужен в момент раскола Зоакристала Имакарума. Он Развёл воду в разные стороны над местом Падения Имакарума и отнёс на остров Силха, где поместил в свою капсулу для выздоровления. Агито решил вернуться к своей организации Молния Зевса в Америке. Он прибыл туда как раз во время атаки на неё Зоаноидов и спас положение... Чуть позже Рихард Гиот живой проходил возле Облачных Врат.

Аптом устроил для Шо взбучку, заманив его на брошенную фабрику, превратившись в Имакарума и Команду Гипер Зоаноидов 5. Шо показал свою слабость, в этой псевдо драке он потерял контроль над Гигантиком когда Гайвер 3 в Аризоне призвал Гигантскую Броню для себя. Гигантик Дарк сделал вид, что хочет разрушить базу Кроноса в Аризоне. На самом деле его задачей было похищение доктора Альфредо Хеккаринга, который обладал огромными знаниями по Зоаформингу. Устроив погром на базе Гигантик Дарк выкрал его запихнув в грузовой контейнер и перевёз в новое место в горах в Колорадо (США). Там была основана база Молнии Зевса и созданы Зоаноиды Либертус которыми стала командовать Гризельда - Шизу Онума прошедшая процесс превращения в Зоалорда.

В Токио три Зоалорда, Крумеггник, Джарвил и Кабрал решают выманить и самим захватить Гайвера 1. Они направляют троих Гипер Зоаноидов - Братьев Бранчай, который сливаясь друг с другом формируют тело, похожее на Гигантик Гайвера и начинают сеять разрушение в городе. Шо отправляется за этим "фальшивым Гигантиком", зная, что это ловушка. Он уничтожает его и тут же встречается с Пургсталом, который не знает о замысле троих Зоалордов и считает Гайвера 1 виновным в разрушениях. В ходе драки с Пургсталом Гигантик Гайвер теряет оба Высокочастотных Меча и все Усилители энергии. Пургстал получает серьёзную травму и сражается дальше намного слабее, Гигантик Гайвер пробивает его барьер. Тут в драку вмешиваются троица Зоалордов, и Агито, который осуществляет в этот момент нападение на исследовательский центр в Вашингтоне, забирает контроль над Гигантской Бронёй. Аптом выручает Шо, он отвлекает всё внимание Зоалордов на себя и попадает в плен. Гайвер 1 убегает скрывшись под землёй. Трое Зоалордов тут же убивают Пургстала, который понял, что Гайвер 1 был подставлен. На место событий прилетает Зоалорд Шин Рубэо Амникалас и видит труп Пургстала, якобы убитого Гигантик Гайвером. Двое репортёров, Асо и Токивадайра, запечатлевают сцену убийства Пургстала на фотоаппараты.

Гигантик Дарк тем временем разрушает одну из трёх башен 1000 метрового небоскрёба штаб-квартиры Кроноса в Вашингтоне.

Алканфель находясь в Ковчеге стреляет из его пушки потоком Био-энергии прямо в Имакарума на острове Силха и тот пробуждается совершенно здоровым. Он направляется на Ковчег, забирает от туда уснувшего Алканфеля и переносит его на Силху.

Гайвер 1 и Хайами направляются в Облачные Врата чтобы выручить Аптома. Они сражаются с группой Энзаймов 3, проникают в комнату, где держат закаменевшее тело Аптома. Гайвер 1 обнаруживает, что за ними следят - он убивает невидимого Зоаноида - Гастала. Тут же срабатывает какой-то защитный механизм, тело Аптома разрушается. Часть Аптома сливается с Гасталом, но его мозг не может восстановится из-за введённых клеток и Аптом под мысленным управлением Зоалорда Кабрал Хана начинает сражаться с Гайвером 1 и Хайами. Злой Аптом (Аптом 5) становится невидимым и пронзает Хайами ухватив его клешнёй за сердце. Хайами замораживает его и Гайвер 1 стреляет по Аптому из Мега-сокрушителя. Оставшийся кусок плоти Аптома сливается с безжизненным телом Хайами, Аптом восстанавливается в нормальном виде.

В это же самое время Гигантик Дарк вместе с Гризельдой и группой Зоаноидов Либертус нападают на базу в Аризоне и Агито проникает на нижний уровень базы, к последнему полуразрушенному Кораблю Создателей. Он хочет заполучить Навигационные Сферы корабля. Здесь он ввязывается в драку с тремя Зоалордами - Балкусом, Ли Ентсуи и Ваферданосом. Доктор Балкус до этого запустил отсчёт до самоуничтожения базы. Ли Ентсуи в ходе драки рассечён на двое и находится на грани смерти. В Токио Зоалорд Кабрал приходит в ярость, но переходит в боевую форму Драгонлорда поглощая Зоаноидов со всего Токио. Гайверу 1 удаётся вернуть контроль над Гигантиком, а Агито в Аризоне его лишается и не может восстановить. Либертусы напрыгивают на Ваферданоса и взрываются вместе с ним. Агито хватает Гризельду и в последний момент перед взрывом базы прыгает в портал, который был открыт Ли Ентсуи и через который сбежал Балкус с Навигационными Сферами. Балкус наблюдая с расстояния за взрывом базы получает несколько выстрелов Инфракрасного Лазера Гайвера 3 и падает на землю...

Кабрал Хан заканчивает трансформацию в Драгонлорда - огромного драконоподобного монстра. Он давит ногой Гигантика и хватает Аптома лапой. Шо высвобождает настоящую силу Гигантика, он трансформируется в Красного Гиганта (Gigantic Exceed, Red Giant) - та же форма, что и Гигантик, но 60 метров в высоту. Драгонлорд отступает под натиском новой силы Гайвера 1, он поглощает ещё зоаноидов, из его спины вырастаю крылья и Драгонлорд взмывает в небо. После чего направляет в сторону Красного Гиганта несколько огромных Био-ракет, которые проникают сквозь барьер и взрываются внутри него. Красный Гигант падает на город, а Кабрал пускает ещё несколько ракет по Токио. Шин видя это быстро трансформируется в боевую форму и сбивает одним выстрелом энергии большинство ракет, оставшиеся падают на город принося огромные разрушения. Красный Гигант пытается сбить одну из ракет и промахивается, видя, что ракета летит прямо в дом, на котором стоят два репортёра - Асо и Такивадайра, Шо закрывает его барьером и принимает удар ракеты на себя. Кабрал готовится выстрелить мощнейшим из своих оружий - Shin Purgatorium, а Шо готовит своё новое оружие - Гравитационную Бездну. Аптом тем временем незаметно приземлился на тело Кабрала и решился на слияние, хотя и знал, что тело Зоалорда защищено от поглощения Зоакристалом также, как и тело Гайвера защищено Контрольным Устройством. В итоге слияние началось, Аптом уже был на полпути к успеху, но Кабрал остановил процесс и выстрелил. Шо произвёл выстрел прямо навстречу выстрелу Кабрала. Гравитационная Бездна засосала и выстрел Кабрала и его огромное тело. Как оказалось, Кабрал сумел спастись, вылетев из тела Драгонлорда внутри Биоракеты, и приземлился на крыше одного из домов. К удивлению Кабрала, на крыше его встретил Аптом в форме Био-Фризера (Хайами Ташиаки). Аптом тут же трансформировался в новую форму - Аптом 6 и заморозил Кабрала. Зоалорд рассыпался, а его Зоакристал начал падение вниз, на улицы города, где его притянул к себе и взял в руку таинственный персонаж в доселе невиданной броне и маске, скрывающей лицо. Тем временем Шо снял броню и его встретили двое репортёров - Асо и Токивадайра, которые тоже наблюдали за битвой.

Через три месяца, в небоскрёбе штаб-квартиры Кроноса в США, Столбах Небес, Доктор Балкус лежа на больничной койке, принимает у себя Шина. Балкус рассказывает, что после полученных от Гайвера 3 повреждений, он был найден Санитарной Службой в пустыне, а Навигационные Сферы были украдены Гайвером 3. Два месяца из трёх Балкус пролежал не приходя в сознание. Внезапно Столбы Небес сотрясает и сотрудник Кроноса сообщает Балкусу о взрыве в подземном блоке "D" и о возможном вторжении нарушителя. Отряд Зоаноидов направляется на место и сталкивается с Женщиной Гайвером. Она легко расправляется с ними и проделывает Мегасмашером дыру в небоскрёбе. Балкус объясняет, что учёные Кроноса имели на руках образцы ткани Био-брони и чтобы создать свою собственную броню они сконструировали искусственное КУ. Видимо что-то пошло не по плану. Балкус замечает, что Женщина Гайвер более опасна для Кроноса чем Гайвер 3. Неподалёку от Столбов Небес, Женщина Гайвер снимает броню и обнаруживает, что Искусственное Контрольное Устройство далеко от идеала - вся её одежда буквально испаряется сразу после отзыва брони.

На поверхность Ковчега телепортируется таинственный Чёрный Рыцарь. Он проникает внутрь, продвигается к центральному уровню, где встречает Зоалорда Эдварда Каэрлеона, который наблюдал за парящими в воздухе Зоакристаллами Пургстала, Ли Ентсуи и Ваферданоса. Эдвард заметил, что Чёрный Рыцарь подчинил своей воле двух Зоаноидов, охранявших эту комнату. Чёрный Рыцарь предлагает Эдварду не сопротивляться и отдать Зоакристаллы по-хорошему. Он показывает свою силу - Эдвард чуствует, что аура Чёрного Рыцаря подавляет его. Чёрный Рыцарь называет себя Аполлионом (?-или Аполлоном), предвестником забвения. Эдвард трансорфмируется в боевую форму и начинает сражение с аполлионом... В это время фотографы Асо и Токивадайра навещают Шо и остальных в их убежище в особняке Одагири. В ходе их разговора Шо высказывает своё намерение сражаться с Кроносом, даже если это будет означать сражение со всем миром.

Зоалорд Эдвард Каэрлеон сражается с Аполлионом и применяет свою способность проникать в другое измерение и проектировать себя в трёх экземплярах в нормальное измерение. Аполлион с лёгкостью повторяет технику Каэрлеона и "разделившись натрое", схватывает все три проекции. Он вынимает его Зоакристалл и забирает три других, которые Каэрлеон охранял. В этой битве последними словами Эдварда были: "Нет, нет, ваше превосходительство, вы...". Эдвард был доставлен на базу на Мёртвом Море. Лишение Зоакристалла вызвало быстрое старение тела и он больше не был бессмертным. Шин, который прибыл навестить Эдварда, разговаривает по видеосвязи с доктором Балкусом. Балкус, основываясь на данных, полученных Ковчегом, делает выводы об Аполлионе. По этим данным броня аполлиона сделана из материалов внеземного происхождения и эти материалы схожи с теми, из которых состоит Контрольное Устройство Гайвера. Балкус считает, что аполлион тесно связан с Создателями. Доктор собирается отправиться на остров Силха и доложить Алканфелю обо всём, что случилось. Балкус предупреждает, что следующей целью Аполлиона может быть Шин и делает заключение, что все последние события хотя и выглядят хаотичными, но могут быть связаны между собой и за ними стоит нечто, готовое появиться. И судьба не только Кроноса, но и всей планеты зависит от грядущего великого события.

Женщина Гайвер прибывает в Японию, где в аэропорте города Нарита её встречает отряд из пяти сотрудников Кроноса. Глава отряда обращается к ней по имени Валькирия. Как выяснилось, она - инспектор Кроноса. После короткого разговора Валькирия трансформируется. В ответ на это четверо из отряда принимают боевую форму Энзаймов 3. Валькирия называет себя Женщиной Гайвером 2 и начинает сражаться. Глава отряда трансформируется в боевую форму Гипер Зоаноида неизвестного типа и становится невидимым. Валькирию одолевают Энзаймы 3, она пытается взлететь, но её останавливает ещё одна способность главы отряда - нечто, напоминающее барьер Зоалорда. Валькирия, используя выстрелы из Пушки Давления и свои Головные Сенсоры, определяет диаметр окружающего её барьера и местоположение Гипер Зоаноида. Глава отряда зовёт на помощь Энзаймов 3, но они не успевают, и Женщина Гайвер 2 рассекает его пополам. Энзаймы 3 наступают, Искусственное Контрольное Устройство начинает барахлить и появляется опасность быть поглощённой Био-бронёй. У Валькирии вряд ли был шанс уйти живой, если бы не вмешался наблюдавший за схваткой Аптом, незаметно заморозивший Энзаймов 3. Валькирия его не заметила, так что не понимала, что происходит, однако сразу воспользовалась ситуацией и уничтожила замёрзших врагов Звуковым Ударом. Чуть позже Аптом отправляется в Токио и рассказывает Шо обо всём увиденном.

Где-то в центре горной системы Каракорум, на секретной базе Зоалорда Луггнагга Дэ Крумеггника, владелец базы и другой Зоалорд-предатель - Джабир Ибн Хайан, разговаривают о последних событиях в мире и об Аполлионе в частности. Джабир говорит, что из-за опасности, связанной с Аполлионом, будет опасно совершать какие-либо действия, на что Луггнагг отвечает, что им двоим совсем не обязательно высовываться, что пока им будет интереснее понаблюдать за тем, что будет делать находящийся на той же базе Рихард Гиот, которому они собираются вернуть часть силы Зоалорда...

На секретной базе сопротивления Молнии Зевса в штате Колорадо, Агито, доктор Хеккаринг и Шизу начинают первый эксперимент по вхождению в контакт с украденными из Аризоны Навигационными Сферами. Гайвер 3 успешно налаживает с ними связь и удивляется их содержимому. Навигационные Сферы заключают в себе данные, накопленные за миллионы лет...

Женщина Гайвер

Зря они так об Иване...

создатели назвали Гайвером человека совмещённого с их Био-бронёй, это слово означало на их языке что-то "вне контроля" или "за пределами нормы"

Гигантик Дарк разрушил Чёрную Дыру выстрелом из Гига-сокрушителя и тут же нанёс мощный удар рукой прямо по его Зоакристалу.

Они объяснили ему, что эксперимент на Земле окончился провалом, а на просьбу Алканфеля взять его с собой ответили отказом, сказав ему, что он потенциально вне контроля и не пригоден.

Он обрадовался и призвал Ремувер, потом попытался снять Био-броню с Агито