Стучит крышка багажника не из-за замка, а скорее всего из-за петель, сами петли затянул до упора, но не помагло. Подскажите это как-нибудь лечится, не меняя сами петли?

Выкручивая отбойники. Рукой пошатай крышку, если перестала болтаться, ехай; на ходу если стучит, подтяни еще. Я так регулировал.

Подтягивать уже некуда, до упора болты ввернул, уже стачиваются

Да какие болты, резиновые отбойники, в крышке багажника две, по краям, выкручиваешь - вкручиваешь типа регулируешь. Если они затянуты, или вытянуты на всю, посмотри сам замок, там втулка такая медная, куда штырек входит, бывает он стучит, если стачивается. А вообще должна быть геометрия, закрытая крышка повторяет форму кузова, обычно выпирает задняя часть, где надписи, из-за этого крышка не лежит плотно на уплотнителе и гремит и щелит, лечится прокладками под петли, очень гемморно, потолок снимать. Если расшатались петли, то проверить так: свинчиваем стойку с одной стороны, шатаем крышку, если не стучит, переходим на другую стойку, ну можно ттянуть на всю и так проверить, не выкручивая стоечки. Замок вообще целая проблема: регулировал полчаса, сажал на доп. шайбы.

а о каком багажнике (кузове) речь вообще?

Речь о хэтчбеках идёт, а что есть какие то предложения?