Мне пару раз меняли подъемники. Технология в общем такая же только стекло не вытаскивается из двери.
Начну сразу с соединения подъемника со стеклом.
Было так:
1.закрыли полностью стекло,
2.подняли подъемником кронштейн крепления привода подъемника со стеклом,
3.состыковали их вместе, затянули, но без усердия,
4.опустили-подняли,
5.опустили подняли,
6.устранили перекос (отпустили стекло, чтоб взяться рукой, поставили ровно, затанули насмерть),
=проблем никаких нет
Если рамка не полностью прилегает к кузову, то надо делать как сказал NVO_21102. И не стесняйтесь, в смысле можно прикладывать достаточное усилие.
Имел удовольствие посетить конвеер АВТОВАЗа, там на установке замков дверей и их "регулировке", такие крепенькие мужички, похожие на мясников, с молотками. Если что-то не так они "придают" форму по месту.