На правах бывшего инженера по вентиляции и кондиционированию:
1. Разница по температуре наружняя/внутренняя не должна превышать более 5 градусов. Если превышает - тут уже у кого какой иммунитет.
2. При работающем кондее необходимо пить воду, т.к. кондей сушит воздух, вы им дышите и осушаете горло и его слизистую,что чем-то там чревато. Это уже из области медицыны, я в этом не шарю.
3. Регулярная чистка кондея. Как тут уже писали, чистим испаритель (тот что в салоне). Конденсатор (под капотом) чистят для того, чтобы холодил получше. На литр горячей воды одну упаковку аспирина (ацетилсалициловой кислоты) и всё это распылить в воздухозаборник, дать покиснуть и просушить. В магазах полно всяких очистителей кондеев - выкинутые деньги да ещё и воняет после них, типо с ароматизатором. Кстати бытовые сплиты также чистятся, и нефиг вызывать там всяких специалистов за 2000 рэ с их чудо средствами, все они на аспирине замешаны, ну или на чём-то подобном.

Да и ещё такой момент: микроклимат регулирует температуру на выходе опираясь на показания датчика температуры на входе, которую вы и выставляете. По этому на выходе из кондея воздух идёт с гораздо меньшей температурой, а не с той которую вы выставили. По этому никогда не направляйте поток воздуха на людей - продует низкотемпературным сквозняком.